Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms