Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2dnl1A2AFH1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl1A2AFH1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms