Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbbp8nlA2ABX0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms