Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms