Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm16A2A935 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm16A2A935 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms