Protein–RNA interactions for Protein: A2A6A1

Gpatch8, G patch domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpatch8A2A6A1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gpatch8A2A6A1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gpatch8A2A6A1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpatch8A2A6A1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms