Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms