Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms