Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms