Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms