Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700028J19RikA0A0U1RP08 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms