Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYP6

Sirpb1a, Signal-regulatory protein beta 1A, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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