Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Clstn1Q9EPL2 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Clstn1Q9EPL2 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Clstn1Q9EPL2 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Clstn1Q9EPL2 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Clstn1Q9EPL2 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Clstn1Q9EPL2 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Clstn1Q9EPL2 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Clstn1Q9EPL2 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Clstn1Q9EPL2 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clstn1Q9EPL2 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms