Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Cldn23Q9D7D7 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Cldn23Q9D7D7 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Cldn23Q9D7D7 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Cldn23Q9D7D7 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Cldn23Q9D7D7 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Cldn23Q9D7D7 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Cldn23Q9D7D7 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Cldn23Q9D7D7 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Cldn23Q9D7D7 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Cldn23Q9D7D7 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Cldn23Q9D7D7 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Cldn23Q9D7D7 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms