Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d3Q9CSV6 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms