Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms