Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Psme4Q5SSW2 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Psme4Q5SSW2 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms