Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Ctnnd1-214ENSMUST00000111688 6146 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Olfr943-205ENSMUST00000215770 8308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Shank3Q4ACU6 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Shank3Q4ACU6 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Shank3Q4ACU6 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Shank3Q4ACU6 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Shank3Q4ACU6 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Shank3Q4ACU6 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Shank3Q4ACU6 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Shank3Q4ACU6 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Shank3Q4ACU6 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Shank3Q4ACU6 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Shank3Q4ACU6 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Shank3Q4ACU6 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Shank3Q4ACU6 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms