Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp19Q3UJD6 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp19Q3UJD6 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms