Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Q3U6N9 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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