Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Usp39Q3TIX9 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Usp39Q3TIX9 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Usp39Q3TIX9 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Usp39Q3TIX9 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Usp39Q3TIX9 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Usp39Q3TIX9 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Usp39Q3TIX9 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Usp39Q3TIX9 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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