Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms