Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sh3bp1P55194 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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