Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cd28P31041 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cd28P31041 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cd28P31041 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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