Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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