Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Ccl20O89093 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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Ccl20O89093 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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Ccl20O89093 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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Ccl20O89093 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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Ccl20O89093 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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Ccl20O89093 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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Ccl20O89093 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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Ccl20O89093 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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