Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

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Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccdc180J3QNE4 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccdc180J3QNE4 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccdc180J3QNE4 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccdc180J3QNE4 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccdc180J3QNE4 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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