Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms