Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms