Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp29Q9ES63 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms