Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
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