Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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