Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
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Ccdc18Q640L5 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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Ccdc18Q640L5 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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Ccdc18Q640L5 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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Ccdc18Q640L5 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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Ccdc18Q640L5 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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Ccdc18Q640L5 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
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Ccdc18Q640L5 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
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