Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxa13Q62424 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms