Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SbdsP70122 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SbdsP70122 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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