Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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Sh3bp1P55194 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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