Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Nedd1P33215 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Nedd1P33215 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms