Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Nfat5-214ENSMUST00000169453 13380 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC8.02□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms