Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms