Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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PdgfraP26618 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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PdgfraP26618 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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