Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P20040 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P20040 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P20040 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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