Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms