Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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Ccl20O89093 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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