Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Q1O19441 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Q1O19441 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
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