Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

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Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc180J3QNE4 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc180J3QNE4 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc180J3QNE4 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc180J3QNE4 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Ccdc180J3QNE4 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc180J3QNE4 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms