Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Spocd1B1ASB6 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms