Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tspan4Q9DCK3 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms