Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Nop56Q9D6Z1 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms