Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rprd1bQ9CSU0 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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