Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Top1mtQ8R4U6 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms